b - genomowa | – zbiór fragmentów chromosomalnego i organellarnego DNA organizmu umieszczonych w określonych w |
- biblioteka cDNA | - analogiczny zbiór fragmentów DNA powstałych na matrycy mRNA poprzez odwr tr tylko akt geny |
regiony 5’UTR i 3’UTR | rejony RNA lub kodującego je DNA który nie ulega translacji, wchodzą w skł mRNA ale nie zaw inf |
5’ to zawsze | początek, bo na rybozie są ponum C – grupa fosf połą jest do 5 C ryb |
DNA zawsze migruje do | o + (to kwas z resztami fosforanowymi), szybciej migrują cząsteczki małe. |
CDS | sekwencja kodująca /coding sequence z ang/ |
Plazmidy bakteryjne | • gen markerowy (marker selekcyjny) (odporności) • miejsce klonowania (MCS) = polilinker • or |
szlak lizogeniczny | zintegrować się z chromosomem bakteryjnym i może się z nim dzielić – |
szlak lityczny | namnaża się wirus, aż do przepełnienia się komórki i jej obumarcia |
sekwencją cos | może być markerem, wskaz koniec, a gdzie zaczyna genom w konkatamerze co pomiędzy sekw wch do g |
Łysinka fagowa | zdechłe bakterie i bakeriofagi. Brak zmętnienia, bo brak rosnących żywych bakterii |
Liza konfluentna` | - bakterie nie zdążają się namnożyć nie możemy rozpoznać pojedynczych łysinek fagowych |
Tworzenie nakładających się fragmentów DNA przez częściowe trawienie | – dajemy za mało enzymu restrykcyjnego np. 4 razy mniej itd. dzięki temu DNA będzie trawione na |
Kosmidy | Zmodyfikowane plazmidy z sekwencją cos umożliwiającą pakowanie DNA do otoczki faga lambda |
Bakteriofagi jednoniciowe (M13, f1, fd) – b popularne | dużych ilości jednoniciowego dna,pakowanie podczas wyrzucania za kom, z wirusem rosną 2 x wolniej |
Fagmidy | Zlinearyzowany wektor z lepkimi końcami. Zlepiamy go z naszym DNA i dostajemy fagmid i pakujemy go |
• Pfu (plaque forming unit) | jednostka tworząca łysinkę, najczęściej pojedynczy fag, ale nie zawsze |
Miano biblioteki | ilość pfu na jednostkę objętości (np. Pfu/mikrolitr) |
• Jednostka aktywności enzymu (jednostka- unit- U)- | taka ilość b enzyma, która strawi całkowicie 1 mikrogram DNA dzikiego bakteriofaga lamb w 1h |
Biblioteka znormalizowana | zróżnicowanie częstości występowania określonych sekwencji zostało wyrównane przy pomocy r |
Przeglądanie różnicowe (differential screening) | w dużym zbiorze klonów wyszuk pojedynczych klonów, ulegających ekspresji tylko w jednej tk ze s |
Subtrakcja - subtraction (tworzenie biblioteki subtrachowanej) | - masowe i automatyczne wzbogacanie zbioru klonów cDNA w te które ulegają ekspresji (występują) |