b - genomowa | – zbiór fragmentów chromosomalnego i organellarnego DNA organizmu umieszczonych w określonych w | |
- biblioteka cDNA | - analogiczny zbiór fragmentów DNA powstałych na matrycy mRNA poprzez odwr tr tylko akt geny | |
regiony 5’UTR i 3’UTR | rejony RNA lub kodującego je DNA który nie ulega translacji, wchodzą w skł mRNA ale nie zaw inf | |
5’ to zawsze | początek, bo na rybozie są ponum C – grupa fosf połą jest do 5 C ryb | |
DNA zawsze migruje do | o + (to kwas z resztami fosforanowymi), szybciej migrują cząsteczki małe. | |
CDS | sekwencja kodująca /coding sequence z ang/ | |
Plazmidy bakteryjne | • gen markerowy (marker selekcyjny) (odporności) • miejsce klonowania (MCS) = polilinker • or | |
szlak lizogeniczny | zintegrować się z chromosomem bakteryjnym i może się z nim dzielić – | |
szlak lityczny | namnaża się wirus, aż do przepełnienia się komórki i jej obumarcia | |
sekwencją cos | może być markerem, wskaz koniec, a gdzie zaczyna genom w konkatamerze co pomiędzy sekw wch do g� | |
Łysinka fagowa | zdechłe bakterie i bakeriofagi. Brak zmętnienia, bo brak rosnących żywych bakterii | |
Liza konfluentna` | - bakterie nie zdążają się namnożyć nie możemy rozpoznać pojedynczych łysinek fagowych | |
Tworzenie nakładających się fragmentów DNA przez częściowe trawienie | – dajemy za mało enzymu restrykcyjnego np. 4 razy mniej itd. dzięki temu DNA będzie trawione na | |
Kosmidy | Zmodyfikowane plazmidy z sekwencją cos umożliwiającą pakowanie DNA do otoczki faga lambda | |
Bakteriofagi jednoniciowe (M13, f1, fd) – b popularne | dużych ilości jednoniciowego dna,pakowanie podczas wyrzucania za kom, z wirusem rosną 2 x wolniej | |
Fagmidy | Zlinearyzowany wektor z lepkimi końcami. Zlepiamy go z naszym DNA i dostajemy fagmid i pakujemy go | |
• Pfu (plaque forming unit) | jednostka tworząca łysinkę, najczęściej pojedynczy fag, ale nie zawsze | |
Miano biblioteki | ilość pfu na jednostkę objętości (np. Pfu/mikrolitr) | |
• Jednostka aktywności enzymu (jednostka- unit- U)- | taka ilość b enzyma, która strawi całkowicie 1 mikrogram DNA dzikiego bakteriofaga lamb w 1h | |
Biblioteka znormalizowana | zróżnicowanie częstości występowania określonych sekwencji zostało wyrównane przy pomocy r� | |
Przeglądanie różnicowe (differential screening) | w dużym zbiorze klonów wyszuk pojedynczych klonów, ulegających ekspresji tylko w jednej tk ze s | |
Subtrakcja - subtraction (tworzenie biblioteki subtrachowanej) | - masowe i automatyczne wzbogacanie zbioru klonów cDNA w te które ulegają ekspresji (występują) | |